Ned i Džesi Benks su braća – Ned je ambiciozni novinar, a Džesi je mladi, genijalni haker. Ono što se retko viđa na televiziji jeste da je glavni lik Džesi mladi čovek koji ima autizam. Prikazu mentalnog zdravlja serija pristupa delikatno, ali sirovo. Naime, Džesijev autizam nije prikazan kao hendikep, naprotiv – on je genijalac, sposoban za neverovatne stvari. Njih dvojica istražuju novu priču, koja će ih odvesti na put koji nisu mogli ni da zamisle. Uključuju se u veliki istraživački projekat u kome istražuju strogo čuvane tajne, a uskoro shvataju kako su mnogi uključeni u tu priču ućutkani. Sumnjive korporacije, nepouzdana vlada, inteligentne misterije i fenomenalni likovi – to je ono što seriju Šifra čini posebnom i vrednom gledanja.